Каменный собор во имя Архистратига Божия Михаила был построен тщанием прихожан в уездном городе Аткарске в 1818 году. В 1865 году собор был перестроен. В приходе собора числились часть города Аткарска, Аткарская пригородная слобода и четыре деревни: Елизаветино, Средний Колышлей, Нижний Колышлей и Андреевка. Престолов в соборе было три: главный во имя Архистратига Бесплотных сил, в трапезной были устроены престолы в честь Покрова Пресвятой Богородицы и во имя святителя Николая Чудотворца. В штате причта состояли протоиерей, два священника и два псаломщика. Дома для причта церковные. При соборе была церковноприходская школа, в приходе были три школы грамотности: в Аткарской пригородной слободе, в Среднем Колышлее и Нижнем Колышлее. С 1850 по 1853 годы настоятелем аткарского собора был протоиерей Иоанн Покровский, основатель Дубовского женского монастыря.

Летом 1922 года во епископа Аткарского, викария Саратовской епархии, тайно был хиротонисан насельник саратовского Спасо-Преображенского монастыря епископ Николай (Парфёнов; †1939). 18 марта 1923 года его хиротония была утверждена святым Патриархом Тихоном (†1925). Однако по болезни (у него был поврежден позвоночник) епископ Николай так и не побывал в своем кафедральном городе, проживая в Свято-Алексиевском скиту Спасо-Преображенского монастыря. В 1927 году епископ Николай был арестован и после двенадцати лет ссылок и тюрем скончался в больнице Владимирского централа. В 1933 году Михаило-Архангельский собор был закрыт и полностью разрушен.

Михаило-Архангельский приход был образован в 1991 году. Распоряжением Аткарской городской администрации от 25 марта 1992 года приходу был предоставлен в безвозмездное пользование зал в помещении бывшего народного суда, а в 2006 году было передано все здание целиком. После передачи здания в течении нескольких лет велась работа по капитальному ремонту и реконструкции здания храма. В 2009 году работа была завершена.
22 ноября 2009 года Епископ Саратовский и Вольский Лонгин совершил Чин Великого освящения храма.

Службы, действующие при храме:
Воскресная школа. Преподаются Священное Писание Ветхого и Нового Заветов, церковная история, основы церковного искусства, церковно-славянский язык. При воскресной школе действует кружок самодеятельности и рукоделия, библиотека.

Церковно-социальная деятельность:
На приходе имеется социальный работник, ответственный за молодежное служение и катехизатор. Ведется работа по духовному окормлению и оказанию материальной помощи ГАУ СО «КЦСОН Аткарского района», детскому отделению для детей отказников Аткарской ЦРБ, Аткарской психбольнице, неимущим, людям, попавшим в трудное положение.

Приписан: храм в честь Покрова Пресвятой Богородицы в с. Сосновка Аткарского района.
Престол: во имя Святого Архангела Михаила.
Святыни:
икона преподобного Серафима Саровского с частицей его мощей;
икона блаженной Матроны Московской с частицей ее мощей.

Настоятель: протоиерей Виталий Соболевский.
Богослужения:
По воскресным и праздничным дням: Литургия в 09:00, вечернее богослужение в 15:00. По будням: Литургия в 08:30, вечернее богослужение в 17:00.

Проезд: электричка, поезд до г. Аткарска, рейсовый междугородний автобус «Саратов-Аткарск». Расстояние от г. Саратова до г. Аткарска 100 км.